1.处理成本高，难以保证结果，运行不稳定：高浓度且难降解的有机废水由于其自身的特性（例如，水质成分复杂，污染物浓度高）必须使用专业且针对性的技术方法高毒性和可生物降解性差，使一般处理技术难以达到废水处理的效果。当使用专业和针对性的技术方法时，经常会出现更多的问题，例如复杂的操作，更高的投资和运营成本以及不稳定的操作。此外，过程和设备操作不稳定的原因是控制技术和自动化集成不匹配，设计参数和实际操作参数不一致。
2.技术创新能力不足，缺乏核心技术和成套设备：中国缺乏有效污水处理的核心技术和设备的主要原因是中国缺乏核心技术和关键的独立产权设备。在废水核心技术和成套设备方面，我国大部分地区是从国外进口的。在技术研发方面，中国缺乏整合和创新能力。这是因为中国主要由科研机构主导，这些平台有其自身的局限性。在这种情况下，不可避免的是中国缺乏原始的核心技术，以及环保产业和装备制造业的不科学结构。
3.技术研发与工程应用脱节，新技术的工程论证不够，产业化困难：在中国，高浓度论证与推广始终存在技术成果好坏的现象。和难降解的有机废水处理新技术。这是由于缺乏有效的组织机制。由于主题不明确，新技术的转化和推广受到限制。环境保护示范项目不是企业承担的，而是经常移交给科研单位。
4.技术研发与工程应用脱节，新技术的工程论证不够，产业化困难：尽管中国在环境技术评估管理方面采取了很多行动，但仍然存在许多问题，例如环境技术评估该系统并不完善，并且完全科学和系统。技术评估不能满足环保产业发展的需要和环境监管的要求。此外，它还没有与整体环境保护战略和环境技术发展战略有效地统一。
